Curriculum vitae
27.9.2023
Koulutus
Valmistuin filosofian maisteriksi tietojenkäsittelytieteestä Turun yliopistosta 2007. Sivuaineeni olivat matematiikka ja tilastotiede. Graduni aiheena oli koneoppimisen soveltaminen kasvilajien tunnistukseen klorofyllifluoresenssin perusteella.
Myöhemmin olen tehnyt viitisen vuoden ajan samaisella tietojenkäsittelytieteen laitoksella väitöskirjaopintoja syöpäkasvainten tietokoneavusteisesta kuvantamisdiagnostiikasta, mutta keskeytin nämä opinnot henkilökohtaisista syistä.
Suoritin vuonna 2023 Työtehoseura ry:n järjestämän sähköpolkupyörämekaanikkokurssin, johon kuului teoriaopetusta ja työssäoppimisjakso pyörähuoltoyrityksessä.
Työkokemus
2023: Huolsin polkupyöriä harjoittelijana Oy Visan polkupyörähuolto Ab:ssä.
2022-2023: Kunnostin käytettyjä polkupyöriä myyntiin Turun Ekotorilla.
2021–2022: Kunnostin käytettyjä polkupyöriä myyntiin pyöräverstas Recykkelissä Turussa. Tutustuin samalla monipuolisesti erilaisiin polkupyöriin ja niiden täyshuoltoon.
2019–2021: Olin sairauslomalla.
2014-2019: Tein tohtoriopintoja ja työskentelin samalla tutkijana. Tänä aikana työnantajiani olivat Varsinais-Suomen kuvantamiskeskus ja Turun yliopisto. Lisäksi minulle antoivat henkilökohtaista apurahaa Orionin tutkimussäätiö ja Instrumentariumin tiedesäätiö. Tutkimuksen lisäksi osallistuin jonkin verran opetukseen.
2013–2014: Opiskelin itsekseni tohtoriopintoja varten.
2012–2013: Matkailin 6 kk Etelä-Amerikassa tutustuakseni kieleen, kulttuuriin ja ihmisiin.
2007–2012: Työskentelin ohjelmoijana Cadmatic Oy:ssä, joka tekee suunnitteluohjelmistoja tehtaiden ja laivojen rakentamista varten. Toimenkuvani oli yrityksen oman tietokantamoottorin kehitys, ja lisäksi osallistuin yleiseen kehitystyöhon ja asiakaspalvelun tukeen.
Tekniset taidot
Minulla on ammatillista työkokemusta C- ja Python-ohjelmointikielistä, sekä tieteellisistä Python-kirjastoista kuten Numpy, Scipy ja Pandas. Olen käyttänyt hieman myös ohjelmointikieliä R, C++, Ruby ja Java. Osaan myös SQL:ää ja Latexia. Olen pitkään harrastanut ohjelmointia ja käyttänyt Linuxia sekä OpenBSD:tä.
Ohjelmoinnin lisäksi minulla on työkokemusta koneoppimisesta, hahmontunnistuksesta, tekstuurianalyysistä, kuvantamisanalyysistä ja tietokantajärjestelmistä.
Minulla on työkokemusta monenlaisten polkupyörien kunnostamisesta ja huoltamisesta.
Kielitaito
Äidinkieleni on suomi. Puhun ja kirjoitan englantia sujuvasti ja espanjaa kohtalaisesti.
Muuta
Minulla on B-ajokortti, työturvallisuuskortti (2023) ja tulityökortti (2023).
Olen toiminut vuodesta 2006 alkaen The X-Rust Organization ry -yhdistyksessä, joka järjestää epäkaupallisia musiikkitapahtumia Turussa. Siinä olen osallistunut lähinnä roudaukseen ja sekalaisiin tehtäviin.
Harrastan omaksi huvikseni filosofiaa ja politiikkaa.
Julkaisuja
Vertaisarvioidut artikkelit
Toivonen J, Montoya Perez I, Movahedi P, Merisaari H, Pesola M, Taimen P, Boström PJ, Pohjankukka J, Kiviniemi A, Pahikkala T, Aronen HJ, Jambor I. Radiomics and machine learning of multisequence multiparametric prostate MRI: Towards improved non-invasive prostate cancer characterization. PLoS ONE 2019.
Merisaari H, Movahedi P, Montoya Perez I, Toivonen J, Pesola M, Taimen P, Boström PJ, Pahikkala T, Aronen HJ, Jambor I. Fitting methods for intravoxel incoherent motion imaging of prostate cancer on region of interest level: repeatability and Gleason score prediction. Magnetic Resonance in Medicine 2016.
Merisaari H, Toivonen J, Pesola M, Taimen P, Boström PJ, Pahikkala T, Aronen HJ, Jambor I. Diffusion weighted imaging of prostate cancer: Effect of b-value distribution on repeatability and cancer characterization. Magnetic Resonance Imaging 2015.
Toivonen J, Merisaari H, Pesola M, Taimen P, Boström PJ, Pahikkala T, Aronen HJ, Jambor I. Mathematical models for diffusion weighted imaging of prostate cancer using b values up to 2000 s/mm²: correlation with Gleason score and repeatability of region of interest analysis. Magnetic Resonance in Medicine 2014.
Konferenssijulkaisut
Merisaari H, Movahedi P, Montoya Perez I, Toivonen J, Pesola M, Taimen P, Boström PJ, Pahikkala T, Aronen HJ, Jambor I. Diffusion weighted imaging of prostate cancer: mathematical modeling of signal obtained using low b values. Proceedings of the International Society for Magnetic Resonance in Medicine 24 (2016).
Montoya Perez I, Toivonen J, Movahedi P, Merisaari H, Pesola M, Taimen P, Boström PJ, Kiviniemi A, Aronen HJ, Pahikkala T, Jambor I. Diffusion weighted imaging of prostate cancer: Prediction of cancer using texture features from parametric maps of the monoexponential and kurtosis functions. Sixth International Conference on Image Processing Theory, Tools and Applications (IPTA 2016).
Xu TC, Toivonen J, Pahikkala T, Leppänen V. BDMap: A Heuristic Application Mapping Algorithm for the Big Data Era. 14th IEEE International Conference on Scalable Computing and Communications (ScalCom/FUSION 2014).